Simulasi dinamika molekul bentuk Apo Protein FKBP12 dengan struktur awal 2PPN

Setiyoningsih, Dwi Fita (2023) Simulasi dinamika molekul bentuk Apo Protein FKBP12 dengan struktur awal 2PPN. Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.

[thumbnail of ABSTRAK] Text (ABSTRAK)
ABSTRAK.pdf
Download (579kB)
[thumbnail of BAB 1] Text (BAB 1)
BAB 1.pdf
Download (11kB)
[thumbnail of BAB 2] Text (BAB 2)
BAB 2.pdf
Restricted to Registered users only
Download (739kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 3] Text (BAB 3)
BAB 3.pdf
Restricted to Registered users only
Download (138kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 4] Text (BAB 4)
BAB 4.pdf
Restricted to Registered users only
Download (867kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 5] Text (BAB 5)
BAB 5.pdf
Download (361kB)

Abstract

Sistem kekebalan menggunakan reseptor untuk mengatur jaringan pada tubuh. Hal ini biasanya ditemukan pada protein dalam darah , dalam cairan jaringan atau pada permukaan sel. Protein pengikat FK506 (FKBPs) adalah salah satu keluarga dari imunofilin. Seperti imunofilin lainnya, banyak FKBP Memiliki Aktivitas cis-trans peptidyl-prolyl isomerase (PPIase). Selain itu, mereka dapat bertindak sebagai koreseptor untuk produk FK506 dan Rapamycin. Maka dari itu, FK506 dan Rapamycin digunakan sebagai obat untuk menghentikan penolakan sel pada pasien pasca transplatasi. Penelitian ini bertujuan mempelajari interaksi Apo protein FKBP12 dengan struktur awal 2PPN menggunakan metode simulasi dinamika molekul dengan penambahan potesial flooding. Simulasi dinamika selama 40 ns menunjukan nilai RMSD untuk semua atom protein adalah 0,36 nm dan untuk atom penyusun tulang punggung yang mempunyai nilai RMSD 0,34 nm. Dari nilai hasil perhitungan RMSD tersebut dapat diketahui bahwa semua atom protein setelah disesuaikan dengan atom penyusun tulang punggung memiliki nilai yang lebih tinggi daripada atom dengan punyusun tulang punggung saja.

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Department: S1 - Farmasi
Contributors:
Contribution
Contributors
NIDN / NIDK
Email
Thesis advisor
Widjajakusuma, Elisabeth Catherina
NIDN0705047401
ecwidj@ukwms.ac.id
Uncontrolled Keywords: FKBP12, RMSD, RMSF, potensial flooding
Subjects: Pharmacy
Divisions: Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User: Dwi Fita Setiyoningsih
Date Deposited: 24 Jul 2024 06:04
Last Modified: 24 Jul 2024 06:04
URI: http://repository.ukwms.ac.id/id/eprint/40381

Actions (login required)

View Item View Item