Perhitungan energi bebas protein MIP-Rapamycin dengan metode integrasi termodinamika

Amalia, Wa Ode Nur Nisa (2023) Perhitungan energi bebas protein MIP-Rapamycin dengan metode integrasi termodinamika. Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.

[thumbnail of ABSTRAK] Text (ABSTRAK)
ABSTRAK.pdf
Download (308kB)
[thumbnail of BAB 1] Text (BAB 1)
BAB 1.pdf
Download (91kB)
[thumbnail of BAB 2] Text (BAB 2)
BAB 2.pdf
Restricted to Registered users only
Download (238kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 3] Text (BAB 3)
BAB 3.pdf
Restricted to Registered users only
Download (146kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 4] Text (BAB 4)
BAB 4.pdf
Restricted to Registered users only
Download (192kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 5] Text (BAB 5)
BAB 5.pdf
Download (183kB)

Abstract

MIP (macrophage infectivity potentiator) adalah protein yang terdapat pada bakteri Legionella pneumophila dan berperan sebagai faktor virulensi. Bakteri Legionella pneumophila menyebabkan penyakit legionnaire, yang menyerang paru-paru dan dapat menyebabkan kematian. Salah satu obat yang efektif untuk mengatasi masalah tersebut adalah antibiotik yang banyak digunakan pada infeksi yang disebabkan oleh bakteri. Penggunaan antibiotik dalam jangka panjang dan berulang menyebabkan terjadinya resistensi dan untuk mengatasinya adalah dengan cara menemukan target baru. Penelitian ini menghitung perubahan energi bebas antara protein MIP dan ligan Rapamycin dengan metode integrasi termodinamika. Simulasi dinamika molekul dilakukan pada tekanan 1 bar dan 300 K untuk ke-30 kondisi λbonded, λcoul dan λvdw mulai dari 0 sampai 1. Hasil perhitungan yang diperoleh dari perubahan energi bebas pengikatan antara protein MIP dan ligan Rapamycin adalah positif 141,77 kJ/mol. Hal ini menunjukkan bahwa tidak ada interaksi antara protein MIP dan ligan Rapamycin. Oleh karena itu pada percobaan ini tidak menguntungkan karena kondisi parameter pada λ harus diubah sehingga harus dikoreksi kembali.

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Department: S1 - Farmasi
Contributors:
Contribution
Contributors
NIDN / NIDK
Email
Thesis advisor
Widjajakusuma, Elisabeth Catherina
NIDN0705047401
UNSPECIFIED
Uncontrolled Keywords: MIP (macrophage infectivity potentiator), Rapamycin, Legionnaire, dinamika molekuler, perhitungan energi bebas, integrasi termodinamika.
Subjects: Pharmacy
Divisions: Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User: WA ODE N.N
Date Deposited: 25 Jul 2023 05:24
Last Modified: 25 Jul 2023 05:24
URI: http://repository.ukwms.ac.id/id/eprint/36012

Actions (login required)

View Item View Item