Jerubu, Kresensia Nou (2022) Perhitungan energi bebas MIP-RAPAMYCIN dengan metode MMPBSA. Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.
![[thumbnail of ABSTRAK]](http://repository.ukwms.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text (ABSTRAK)
NEW ABSTRAK KRESENSIA.pdf Download (564kB) |
|
Text (BAB 1)
BAB 1.pdf Download (235kB) |
|
Text (BAB 2)
BAB 2.pdf Restricted to Registered users only Download (517kB) | Request a copy |
|
Text (BAB 3)
BAB 3.pdf Restricted to Registered users only Download (223kB) | Request a copy |
|
Text (BAB 4)
BAB 4.pdf Restricted to Registered users only Download (1MB) | Request a copy |
|
Text (BAB 5)
BAB 5.pdf Download (349kB) |
Abstract
Penyakit Legionnaire disebabkan oleh bakteri Legionella pneumophila. Penyakit infeksi bakteri masih merupakan salah satu masalah kesehatan masyarakat yang penting. Salah satu obat andalan untuk mengatasi masalah tersebut adalah antibiotik, antibiotik merupakan obat yang paling banyak digunakan pada infeksi yang disebabkan oleh bakteri. Penggunaan antibiotik dalam jangka waktu lama dan berulang-ulang menyebabkan terjadinya resistensi. Macrophage infectivity potentiator (Mip) adalah faktor virulensi dalam berbagai patogen termasuk Legionella pneumophila. Perhitungan perubahan energi bebas bertujuan untuk mengetahui afinitas, kestabilan, kespontanan dan interaksi antara ligan dan protein target. Dalam penelitian ini digunakan metode molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area (MMBPSA) untuk menghitung perubahan energi bebas interaksi antara kompleks Mip-Rapamycin. Penelitian ini bertujuan untuk menghitung energi bebas ikatan rapamycin terhadap Mip. Hasil dari penelitian ini diperoleh energi van der Waal -230,704 kJ/mol, energi elektrostatik -105,983 kJ/mol, pelarutan polar 184,214 kJ/mol, Energi nonpolar yang terdiri dari SASA (solvent accessible surface area) -22,112 kJ/mol, energi SAV (solvent accessible volume) -177,181 kJ/mol, energi WCA 122,030 kJ/mol SASA,SAV dan WCA adalah komponen penyusun energi pelarutan nonpolar, semua ini merupakan penyusun perubahan energi bebas pengikatan. Perubahan energi bebas pengikatan dari penjumlahan komponen tersebut diperoleh perubahan energi ΔG -229,737 kJ/mol. Perubahan energi bebas pengikatan menunjukan bahwa reaksinya spontan dengan afinitas spontan. 137 residu dari Mip-Rapamycin terdapat sisi aktif sebanyak 12 sisi aktif yaitu Y55, F65, D66, F77, Q81, V82, I83, W86, Y109, P117, I118 dan F126 yang berinteraksi dengan ligan.
| Item Type: | Thesis (Undergraduate) |
|---|---|
| Department: | S1 - Farmasi |
| Contributors: | Contribution Contributors NIDN / NIDK Email Thesis advisor Widjajakusuma, Elisabeth Catherina NIDN0705047401 ecwidj@ukwms.ac.id |
| Uncontrolled Keywords: | Legionnaire, mip, rapamycin, perhitungan energi bebas, MMPBSA (Molecular mechanics poisson-boltzmann surface area). |
| Subjects: | Pharmacy |
| Divisions: | Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program |
| Depositing User: | Users 12357 not found. |
| Date Deposited: | 01 Feb 2023 01:14 |
| Last Modified: | 01 Feb 2023 01:14 |
| URI: | http://repository.ukwms.ac.id/id/eprint/34060 |
Actions (login required)
 |
View Item |