Alkansyah, Rachmaudina (2022) Studi in silico senyawa kandungan dari Cinnamomi Cortex terhadap Reseptor Stimulator Gen Interferon (6DXL). Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.
Text (ABSTRAK)
ABSTRAK.pdf Download (617kB) |
|
Text (BAB 1)
BAB 1.pdf Download (141kB) |
|
Text (BAB 2)
BAB 2.pdf Restricted to Registered users only Download (542kB) | Request a copy |
|
Text (BAB 3)
BAB 3.pdf Restricted to Registered users only Download (466kB) | Request a copy |
|
Text (BAB 4)
BAB 4.pdf Restricted to Registered users only Download (881kB) | Request a copy |
|
Text (BAB 5)
BAB 5.pdf Download (157kB) |
|
Text (LAMPIRAN)
LAMPIRAN.pdf Restricted to Registered users only Download (656kB) | Request a copy |
Abstract
Interferon merupakan jenis protein yang tergabung ke dalam keluarga besar sitokin, yang terdiri dari dua tipe yaitu tipe I dan tipe II. Stimulator Gen Interferon (STING) adalah protein yang pada manusia dikodekan oleh gen STING1. STING menginduksi produksi interferon tipe I ketika sel terinfeksi patogen intraseluler. Amidobenzimidazole (ABZI) merupakan salah satu jenis agonis STING yang dapat membantu menginduksi dan menstimulasi aktivasi STING untuk memproduksi interferon tipe I ketika terdapat sel yang terinfeksi patogen. Beberapa studi menyebutkan bahwa senyawa yang terkandung dalam Cinnamomi Cortex dapat berperan sebagai imunomodulator. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas pengikatan dengan melihat nilai afinitas ikatan (ΔG), konstanta inhibisi (Ki) dan interaksi yang terjadi antara senyawa Cinnamomi Cortex sebagai ligan dan reseptor 6DXL sebagai target. Metode yang digunakan adalah analisis in silico. Proses docking dilakukan terhadap 14 senyawa Cinnamomi Cortex dengan reseptor linked amidobenzimidazole STING agonist dengan kode 6DXL menggunakan program Autodock tools 1.5.6. Hasil penelitian menunjukkan terdapat 4 senyawa yaitu (-)-katekin, (+)-katekin, β-kariofilen dan proantosianidin tipe A yang memiliki afinitas ikatan dan konstanta inhibisi lebih rendah dibandingkan dengan ligan asli HG4 (ΔG < -5,6 kkal/mol dan Ki < 78,72 μM). Residu-residu asam amino yang berperan penting dalam membentuk interaksi antara makromolekul dengan ligan seperti ikatan hidrogen dan ikatan hidrofobik adalah SER241, SER162, TYR167 dan TYR240.
Item Type: | Thesis (Undergraduate) |
---|---|
Department: | S1 - Farmasi |
Contributors: | Contribution Contributors NIDN / NIDK Email Thesis advisor Ervina, Martha NIDN0717027401 martha.pharm@ukwms.ac.id Thesis advisor Widjajakusuma, Elisabeth Catherina NIDN0705047401 elisabeth-c@ukwms.ac.id |
Uncontrolled Keywords: | 6DXL, Cinnamomi Cortex, afinitas ikatan, konstanta inhibisi, interaksi ikatan |
Subjects: | Pharmacy |
Divisions: | Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program |
Depositing User: | Users 11405 not found. |
Date Deposited: | 13 Jul 2022 03:33 |
Last Modified: | 13 Jul 2022 03:33 |
URI: | http://repository.ukwms.ac.id/id/eprint/31402 |
Actions (login required)
View Item |