Studi in silico senyawa kandungan dari Cinnamomi Cortex terhadap Reseptor Stimulator Gen Interferon (6DXL)

Alkansyah, Rachmaudina (2022) Studi in silico senyawa kandungan dari Cinnamomi Cortex terhadap Reseptor Stimulator Gen Interferon (6DXL). Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.

[thumbnail of ABSTRAK] Text (ABSTRAK)
ABSTRAK.pdf

Download (617kB)
[thumbnail of BAB 1] Text (BAB 1)
BAB 1.pdf

Download (141kB)
[thumbnail of BAB 2] Text (BAB 2)
BAB 2.pdf
Restricted to Registered users only

Download (542kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 3] Text (BAB 3)
BAB 3.pdf
Restricted to Registered users only

Download (466kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 4] Text (BAB 4)
BAB 4.pdf
Restricted to Registered users only

Download (881kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 5] Text (BAB 5)
BAB 5.pdf

Download (157kB)
[thumbnail of LAMPIRAN] Text (LAMPIRAN)
LAMPIRAN.pdf
Restricted to Registered users only

Download (656kB) | Request a copy

Abstract

Interferon merupakan jenis protein yang tergabung ke dalam keluarga besar sitokin, yang terdiri dari dua tipe yaitu tipe I dan tipe II. Stimulator Gen Interferon (STING) adalah protein yang pada manusia dikodekan oleh gen STING1. STING menginduksi produksi interferon tipe I ketika sel terinfeksi patogen intraseluler. Amidobenzimidazole (ABZI) merupakan salah satu jenis agonis STING yang dapat membantu menginduksi dan menstimulasi aktivasi STING untuk memproduksi interferon tipe I ketika terdapat sel yang terinfeksi patogen. Beberapa studi menyebutkan bahwa senyawa yang terkandung dalam Cinnamomi Cortex dapat berperan sebagai imunomodulator. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas pengikatan dengan melihat nilai afinitas ikatan (ΔG), konstanta inhibisi (Ki) dan interaksi yang terjadi antara senyawa Cinnamomi Cortex sebagai ligan dan reseptor 6DXL sebagai target. Metode yang digunakan adalah analisis in silico. Proses docking dilakukan terhadap 14 senyawa Cinnamomi Cortex dengan reseptor linked amidobenzimidazole STING agonist dengan kode 6DXL menggunakan program Autodock tools 1.5.6. Hasil penelitian menunjukkan terdapat 4 senyawa yaitu (-)-katekin, (+)-katekin, β-kariofilen dan proantosianidin tipe A yang memiliki afinitas ikatan dan konstanta inhibisi lebih rendah dibandingkan dengan ligan asli HG4 (ΔG < -5,6 kkal/mol dan Ki < 78,72 μM). Residu-residu asam amino yang berperan penting dalam membentuk interaksi antara makromolekul dengan ligan seperti ikatan hidrogen dan ikatan hidrofobik adalah SER241, SER162, TYR167 dan TYR240.

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Department: S1 - Farmasi
Contributors:
Contribution
Contributors
NIDN / NIDK
Email
Thesis advisor
Ervina, Martha
NIDN0717027401
martha.pharm@ukwms.ac.id
Thesis advisor
Widjajakusuma, Elisabeth Catherina
NIDN0705047401
elisabeth-c@ukwms.ac.id
Uncontrolled Keywords: 6DXL, Cinnamomi Cortex, afinitas ikatan, konstanta inhibisi, interaksi ikatan
Subjects: Pharmacy
Divisions: Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User: Users 11405 not found.
Date Deposited: 13 Jul 2022 03:33
Last Modified: 13 Jul 2022 03:33
URI: http://repository.ukwms.ac.id/id/eprint/31402

Actions (login required)

View Item View Item