Simulasi dinamika molekul bentuk Apo dari imunofilin FKBP12

Karin, Clarissa (2021) Simulasi dinamika molekul bentuk Apo dari imunofilin FKBP12. Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.

	Text (ABSTRAK) ABSTRAK.pdf Download (423kB)
	Text (BAB 1) bab1.pdf Download (182kB)
	Text (BAB 2) bab2.pdf Restricted to Registered users only Download (553kB) | Request a copy
	Text (BAB 3) bab3.pdf Restricted to Registered users only Download (52kB) | Request a copy
	Text (BAB 4) bab4.pdf Restricted to Registered users only Download (703kB) | Request a copy
	Text (BAB 5) bab5.pdf Download (361kB)

Abstract

Keadaan di mana sistem kekebalan tidak berfungsi sebagaimana mestinya dikenal sebagai imunosupresi. Penghambatan FKBP12 mungkin memiliki tindakan imunosupresan yang sangat berbeda. Dalam penelitian ini, simulasi dinamika molekuler dilakukan pada bentuk apo imunofilin FKBP12 untuk mendapatkan wawasan tentang fitur struktural dan konformasinya. Konformasi awal kompleks diambil dari Protein Data Base (PDB) 1FKB. Simulasi dinamika molekuler 200 ns menunjukkan nilai RMSD rata-rata untuk semua atom protein dan untuk atom backbone masing-masing sebesar 0,15 dan 0,08 nm. Terdapat tiga subbagian yang memiliki fleksibilitas relatif tinggi. Berdasarkan data yang diperoleh, residu E54, H87, dan I90 merupakan residu yang paling fleksibel di tempat pengikatan. Hasil analisis dPCA menunjukkan adanya perubahan konformasi protein FKBP12.

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Department:	S1 - Farmasi
Contributors:	Contribution Contributors NIDN / NIDK Email Thesis advisor Widjajakusuma, Elisabeth Catherina NIDN0705047401 ecwidj@ukwms.ac.id
Uncontrolled Keywords:	FKBP12, imonufilin, PPIase, dinamika molekul, analisis komponen utama sudut dihedral.
Subjects:	Pharmacy
Divisions:	Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User:	Clarissa Karin
Date Deposited:	12 Jan 2022 06:48
Last Modified:	12 Jan 2022 06:48
URI:	http://repository.ukwms.ac.id/id/eprint/28032

Actions (login required)

View Item