Simulasi protein argonaute dalam pelarut air eksplisit

Gianto, Agus (2010) Simulasi protein argonaute dalam pelarut air eksplisit. Undergraduate thesis, Widya Mandala Catholic University Surabaya.

[thumbnail of ABSTRAK]
Preview
 Text (ABSTRAK)
ABSTRAK.pdf
Download (196kB) | Preview
[thumbnail of BAB 1]
Preview
 Text (BAB 1)
BAB 1.pdf
Download (147kB) | Preview
[thumbnail of BAB 2] Text (BAB 2)
BAB 2.pdf
Restricted to Registered users only
Download (522kB)
[thumbnail of BAB 3] Text (BAB 3)
BAB 3.pdf
Restricted to Registered users only
Download (72kB)
[thumbnail of BAB 4] Text (BAB 4)
BAB 4.pdf
Restricted to Registered users only
Download (863kB)
[thumbnail of BAB 5]
Preview
 Text (BAB 5)
BAB 5.pdf
Download (81kB) | Preview
[thumbnail of LAMPIRAN]
Preview
 Text (LAMPIRAN)
LAMPIRAN.pdf
Download (164kB) | Preview

Abstract

Terapi gen merupakan terobosan baru dalam dunia pengobatan. Salah satu mekanismenya adalah membungkam gen agar tidak mengekspresikan gen yang jelek, abnormal, atau menyebabkan penyakit. Proses ini dimediasi oleh protein Argonaute dimana protein ini adalah kunci dari komponen RNA induced silencing complex (RISC). Dalam penelitian ini, paket program yang digunakan adalah GROMACS 4.0.3 dengan medan gaya GROMOS untuk mensimulasikan protein Argonaute. Molekul protein ini ditempatkan dalam kotak oktahedral dengan variasi jarak minimum periodik 1.6, 2.0, 2.4 nm yang kemudian diisi dengan molekul air SPC. Simulasi dilakukan pada temperatur 310 K, tekanan 1 atm. Pengamatan dilakukan pada sifat struktural dan sifat dinamik protein tersebut. Sifat struktural akan diwakili oleh parameter-parameter seperti jari – jari girasi, Solvent accessible surface, dan RMSD. Sifat dinamik protein tersebut diwakili oleh parameter RMSF. Hasil pengolahan data menunjukkan tidak ada perbedaan berarti pada ketiga simulasi.

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Department: ["eprint_fieldopt_department_Faculty of Pharmacy" not defined]
Uncontrolled Keywords: Terapi gen, RISC, Protein, Protein Argonaute, Pelarut Eksplisit.
Subjects: Pharmacy
Divisions: Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User: Vincentius Widya Iswara
Date Deposited: 20 Mar 2015 02:56
Last Modified: 20 Mar 2015 02:56
URI: http://repository.ukwms.ac.id/id/eprint/1962

Actions (login required)

View Item View Item